Les cours thématiques organisés à Genève portent sur une question ou un ensemble de questions relatives à l'OMC et durent généralement deux semaines. Ils comprennent des séances d'information sur l'état d'avancement des travaux de l'OMC pour ce qui est des questions considérées. Les méthodes de formation employées mettent l'accent sur l'apprentissage interactif, les exercices pratiques, les études de cas et les débats. Des exercices de simulation sont souvent organisés pour permettre aux participants de renforcer leurs compétences.